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平时我们在生物实验室所提到的菌种是指用于发酵过程中作为活细胞催化剂的微生物，其中包括细菌、放线菌、酵母菌和霉菌四大类。菌种是从事微生物学及生命科学研究的基本材料，在医学领域中，诊断制品的制备，菌苗的生产、微生物致病性研究、药物的抑菌试验、药品微生物检验等方面都有一套完整的菌种，菌种又分为母种、原种以及栽培种三级。
菌株和菌种的区别
1、菌株：菌株是一种菌类系列中一个品种，又叫品系，表示同种微生物不同来源的纯种培养，从自然界中分离得到的每一个微生物纯培养都可称一个菌株。
2、菌种：菌种则是用于繁殖的种子，是指食用菌、工业菌、农用菌菌丝体及其生长基质组成的繁殖材料，其中包括细菌、放线菌、酵母菌和霉菌四大类。
菌群、菌型、菌属是什么？
1、菌群：指的是大量真菌或细菌形成肉眼可见的集团，生活在健康动物各部位、数量大、种类较稳定、一般能发挥有益作用的微生物种群叫正常菌群。
2、菌型：同一菌种的不同细菌，在某些方面有较小差异的为同一菌型，通常一个菌种内的细菌可以分为多种不同的菌型。
3、菌属：菌种的上一级分类，通常性状相近、亲缘关系密切的若干菌种组成一个菌属，如芽孢杆菌属、葡萄球菌属、乳杆菌属等。
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